В связи разгоревшимся в Сан-Франциско судом вокруг постройки кафедрального собора в честь иконы Пресвятой Богородицы Всех Скорбящих Радость партия оппозиционная свят. Иоанну обвинила его в том, что она состоял в Московском Патриархате в Шанхае после Второй мировой войны. Отвечая на это, защитники свят. Иоанна и его сотрудники из Шанхая свидетельствовали, что он «никогда не подчинялся Московскому патриарху, ни в какие сношения с Московской патриархией не вступал и с таковой ни в какой связи никогда не состоял» (Монахиня Вера, “Правда о святителе Иоанна Шанхайском чудотворце,”Интернет-собор). В этой фразе ничего не говорится о литургическом поминовении патриарха Алексия (Симанского).
В июле 1945 года Свят. Иоанн Шанхайский в своем послании пастве писал: “В конце июля прошлого года мы получили известие, что харбинские иерархи постановили просить Святейшего Патриарха Московского о принятии их в свое ведение. Мы немедленно написали архиепископу Виктору, что, не имея сведений о судьбе Заграничного Синода и не будучи вправе оставаться вне подчинения высшей Церковной власти, мы должны также войти в сношение со Святейшим Патриархом Московским и при отсутствии препятствий подчиниться ему” (Из послания свят. Иоанна Шанхайского от 2 авг. 1946 г. Цит. по монах Вениамин Гомартели, Летопись церковных событий начиная с 1917 г. Ч.III:1939-1949. Вопросы истории Русской Зарубежной Церкви)
Тогда же, 31 июля 1945 г., владыка Иоанн писал Начальнику Пекинской Миссии архиеп. Виктору: “После решения Харбинской епархии и ввиду отсутствия сведений о Заграничном Синоде в течение ряда лет, иное решение нашей епархии сделало бы ее совершенно независимой, автокефальной епархией. Канонических условий для такой независимости не имеется, так как сомнений в законности <…>признанного Патриарха не имеется. Отношения с той (московской — ред.) церковной властью также делаются возможными, так что неприменим Указ от 7 ноября 1920 г. В настоящее время пока нет никаких оснований оставаться на положении самоуправляющейся епархии, нам надлежит поступить как Харбинская епархия. Возношение имени Председателя Заграничного Синода пока должно быть сохранено, так как по 14-му прав. Двукратного Поместного Собора нельзя самовольно прекращать поминовение своего митрополита. Возношение же имени Патриарха <…> необходимо Вашим Указом ввести безотлагательно во всей епархии… В данное время нам не поставлены условия идеологического порядка, послужившие причиной нашего изменения в церковном управлении за границей. Если вновь будут поставлены неприемлемые условия, сохранение теперешнего порядка церковного управления станет задачей той церковной власти, которую удастся создать в зависимости от внешних условий” (Архив ОВЦС МП, д. № 24. Цит. по монах Вениамин Гомартели, Летопись церковных событий начиная с 1917 г. Ч.III:1939-1949. Вопросы истории Русской Зарубежной Церкви)
Архиепископ Виктор в августе 1945 г. телеграммой просил Патриарха Алексия принять его и святителя Иоанна в свою юрисдикцию. Младшая сестра вл. Виктора О.В. Кепинг вспоминала: «В конце 1944 г., еще во время японской оккупации, архиепископ Виктор отправил в Советское посольство в Пекине своего родственника, мужа своей сестры Бориса Михайловича Кепинга, который отнес туда официальный рапорт на имя Патриарха Московского и всея Руси с просьбой о воссоединении с Патриаршей Церковью». (Кепинг О.В. Последний Начальник Российской Духовной Миссии в Китае — архиепископ Виктор: жизненный путь// Православие на Дальнем Востоке: 275-летие Российской Духовной Миссии в Китае. Спб, 1993. С. 95. Цит. по монах Вениамин Гомартели, Летопись церковных событий начиная с 1917 г. Ч.III:1939-1949. Вопросы истории Русской Зарубежной Церкви)
Завершение вопроса о поминовении патриарха Алексия излагается в Православной Энциклопедии: «Поскольку сообщение Шанхая с Пекином прервалось и ответ на письмо архиеп. Виктора не был получен, 6 сент. И. самостоятельно принял решение о начале поминовения в русских храмах Шанхая имени Патриарха Алексия «независимо от разрешения вопроса о подчинении высшей церковной власти». Однако 2 окт. И. получил краткую радиограмму из Женевы от митр. Анастасия о продолжении деятельности Архиерейского Синода РПЦЗ. Поминовение Патриарха Алексия в Шанхае с этого момента было прекращено. Т. о., И. остался единственным из рус. правосл. архиереев в Китае, не перешедшим в подчинение Московского Патриархата. В нояб. И. получил телеграмму от Западноамериканского архиеп. Тихона (Троицкого), который сообщал, что вместе с архиеп. Восточноамериканским Виталием (Максименко), епископами Монреальским Иоасафом(Скородумовым; впосл. архиепископ) и Детройтским Иеронимом (Черновым; впосл. архиепископ) продолжает оставаться в подчинении митр. Анастасия и не признает юрисдикции Московского Патриархата» [Ref] Л.В. Литвинова, Иоанн, Православная Энциклопедия [/ref]
